现在有多种DNA甲基化的检测的新办法：①限制性内切酶-Southern杂交法使用某一种酶对酶切位点的甲基化不灵敏，而对另一种酶灵敏，Southern杂交剖析中可得到巨细不同的信号。该办法成本低，甲基化位点清晰，成果易于解说，但需很多的DNA(
5 μg),只能检测数量有限的几种位点的甲基化。②亚硫酸氢钠润饰反响是用胞嘧啶与亚硫酸氢钠的反响能够敏捷辨别出任何序列的5mC。单链DNA中胞嘧啶经过磺酸基作用脱氨基构成U。该润饰反响分为三个过程：DNA变性、脱嘌呤和单链特异性PCR(ssPCR)。结合这种办法使用基因组测序或MSP扩增能够在任何实验室展开。近来，根据定量PCR的办法，例如MethyLight和Pyrosequencing，这一些办法的长处是扩展了DNA甲基化检测区域，缺陷是上述反响是在特定的引物下引发的，不能彻底反映某个样本的甲基化主导趋势并且关于异质化的甲基化形式不能供给完好的描绘。③结合限制性内切酶法和定量PCR办法引出的RLGS，这种办法的长处是在肿瘤剖析中能够给咱们供给遗传和表观遗传相联系的额定优势，缺陷包含：特异性的酶切位点不能在所有的CpG岛中供给，并且意图片段不能悉数在电泳中呈现。④恣意引物PCR，包含：甲基化灵敏恣意引物PCR，甲基化CpG岛扩增（MCA）和内甲基化位点扩增（AIMS），这种办法主要是用来特异性的扩增CpG岛和基因富集区，缺陷是要进一步的验证，和消除来自基因组中重复序列导致的搅扰。⑤根据芯片技能的差异甲基化杂交办法（DMH），近来改善的相关办法HELP，这类办法的长处是能够检测某个区域内很多的CpG，并且避免了上述办法中需求的克隆和测序，经过正常细胞和肿瘤细胞比照，能够给咱们供给肿瘤基因组形式。⑥根据染色质免疫共沉淀原理的办法，长处是能够终究靠公司或购买试剂盒，使剖析DNA甲基化形式简单化和普及化，缺陷是任何芯片扫描成果不能代表人类基因组CpG岛形式，经过免疫共沉淀介入的PCR有违背。⑦最终，便是结合去甲基化药物剖析甲基化形式，主要是结合⑥中 CHIP-on-chip。
介绍你看一下Manel Esteller 2007年宣布在NATURE的review：
Cancer epigenomics: DNA methylomes and histone-modification maps
也能够用MeDIP-qPCR,是PCR结合chip的一种办法!能够学习Weber, M., et al. (2007) Distribution, silencing potential and evolutionary impact of promoter DNA methylation in the human genome. Nat Genet 39(4), 457-466.咱们也供给相关服务!详细资料能够EMAIL我!
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